caracterizacion omg

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18/12/2014 1 DESARROLLO Y CARACTERIZACIÓN DE UN OGM MSC. LÁZARO NÚÑEZ CÁRDENAS BIOTECNOLOGÍA MODERNA Uruguay Dic-2014 2 - Enzimas de restricción - Ligasas - Plásmidos - Agrobacterium tumefasien «Todo organismo cuyo material genético fue modificado por medio de la tecnología de genes de una forma tal que no ocurre en la naturaleza por multiplicación y/o por recombinación natural.» (Antunes, Guerrante, Pereira Junior, 2003) Uruguay Dic-2014 3 Conceptos básicos relacionados a la Biotecnología Moderna

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desarrollo y caracterizacion OMG

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  • 18/12/2014

    1

    DESARROLLO Y CARACTERIZACIN DE UN OGM

    M S C . L Z A R O N E Z C R D E N A S

    BIOTECNOLOGA MODERNA

    Uruguay Dic-2014 2

    - Enzimas de restriccin

    - Ligasas

    - Plsmidos - Agrobacterium tumefasien

    Todo organismo cuyo material gentico fue modificado por medio

    de la tecnologa de genes de una forma tal que no ocurre en la

    naturaleza por multiplicacin y/o por recombinacin natural.(Antunes, Guerrante, Pereira Junior, 2003)

    Uruguay Dic-2014 3

    Conceptos bsicos relacionados a la Biotecnologa Moderna

  • 18/12/2014

    2

  • 18/12/2014

    3

    Uruguay Dic-2014 14

    Desarrollo de un OGM

    BIOTECNOLOGA MODERNA

    Uruguay Dic-2014 15

    - Enzimas de restriccin

    - Ligasas

    - Plsmidos - Agrobacterium tumefasien

    Todo organismo cuyo material gentico fue modificado por medio

    de la tecnologa de genes de una forma tal que no ocurre en la

    naturaleza por multiplicacin y/o por recombinacin natural.(Antunes, Guerrante, Pereira Junior, 2003)

    DESARROLLO DE UN OVGM

    Uruguay Dic-201416

    PLANTAS MICROORGANISMOS ANIMALES

    ARNm

    PROTEINA/ENZIMAS

    METABOLITOS

    ARNm

    PROTEINA/ENZIMAS

    METABOLITOS

    ARNm

    PROTEINA/ENZIMAS

    METABOLITOS

    Mtodos de obtencin en

    animales

    Microinyeccin pronuclear de ADN.

    Manipulacin de clulas embrionarias.

    Clonacin somtica. Transferencia de genes

    mediada por espermatozoides

    Vectores lentivirales

    Mtodos de obtencin en plantas

    Agrobacteriumtumefaciens.

    Transferencia por polietilenglicol.

    Microinyeccin. Tecnologa de

    electroporacin de clulas intactas

    Lanzagenes o biolistica.

    Uruguay Dic-2014 17

    Ejemplos de Transgnesis en Animales

    Transferencia de genes mediada por espermatozoides

    Promotor ADNc del gen

    XPA

    Seleccin del donante de semen.

    Colecta del semen.

    Lavado de los espermatozoides y coincubacin con el ADN de inters.

    Inseminacin artificial.

    PA: Secuencia de corte y poliadenilacin

  • 18/12/2014

    4

    Transferencia de genes mediada por

    espermatozoides

    Limitaciones de la SMGT.Se desconocen los eventos moleculares que

    median la internalizacin del ADN en los

    espermatozoides.

    Es necesario evaluar un gran nmero de

    sementales antes de encontrar uno con las

    caractersticas adecuadas para el procedimiento.

    Baja reproducibilidad.

    Escepticismo.

    ADN unido a espermatozoides

    Blastosistos

    multitransgnicosWebster NL, Lavitrano ML et al., (2005). Multi-transgenic pigs expressing three fluorescent proteins produced with high

    efficiency by sperm mediated gene transfer. Mol Reprod Dev. 72:68-76

    Microinyeccin pronuclear de ADN

    Consiste en la microinyeccin directa de ADN desnudo en el

    proncleo masculino de un embrin fertilizado.

    Si el material gentico se integra en uno de los cromosomas

    embrionarios, el animal nacer con esta nueva informacin en cada

    clula.

    El ADN forneo debe integrarse en el genoma antes de la duplicacin

    del material gentico que precede al primer clivaje.

    Construccin de un cassette de expresin para microinyeccin.

    Promotor ADNc del gen X PA

    Promotor PA

    ADN genmico del gen X

    PAPromotor gen

    Xgen

    Y

    IRES

    IRES: Internal ribosome entry

    sitePA: Secuencia de corte y poliadenilacin

    Microinyeccin pronuclear de ADN

    50 m

    Tratamiento hormonal para inducir la

    maduracin de los folculos y la ovulacin.

    Transferencia a hembra pseudogestada

    Chequeo de la progenie para detectar las

    cras transgnicas (PCR, Southern blot).

    Cruzamiento de los transgnicos fundadores

    para obtener una lnea homocigtica.

    Colecta de los zigotos

    Microinyeccin pronuclear del transgn

    Microinyeccin pronuclear de ADNPasos para la generacin de un ratn transgnico por

    microinyeccin.

    Microinyeccin Pronuclear de ADN

    Limitaciones de la Microinyeccin Pronuclear

    1. Efecto de posicin:

    Los transgenes se integran en zonas de la cromatina transcripcionalmente inactivas o silentes.

    Los transgenes que se integran en secuencias codificantes nativas podran conducir a una discapacidad

    o a la muerte del animal transgnico.

    2. Integracin de mltiples copias:

    Antes de que ocurra la integracin, los casetes de expresin pueden formar concatmeros de forma tal

    que mltiples copias del transgn se integran en una posicin nica del genoma.

    Estos concatmeros inducen silenciamiento mediado por metilacin de las citosinas o

    heterocromatinizacin.

    3. Eficiencia de integracin:

    La eficiencia de integracin del transgen mediante MIP difiere significativamente entre las especies

    [ratn (5%), conejo(5%), cerdo (2%), cabra y oveja (1%), vaca (-1%)].

    Wells K., Moore K., Wall R., (1999). Transgene vectors go retro.Nat. Biotech. 17: 25-26.

    Aplicaciones

    Produccin de protenas recombinantes. (Cultivos Celulares)

    Fibra Hueca

    Rollers

    Suspensin

  • 18/12/2014

    5

    Aplicaciones

    Produccin de protenas recombinantes.

    Empleo de animales como biofactoras para la produccin de protenas recombinantes en fluidos corporales:

    Sangre

    Orina

    Lquido seminal

    Saliva

    Leche

    Fisiologa de la glndula

    mamaria

    Capacidad de sntesis: 2gr/leche por gr de tejido por da

    Alta densidad celular: 2x108 clulas/gr de tejido (100 o

    1000 ms alto que en cultivos celulares)

    Produccin de leche 10-8 gr/clula/da

    Animal Drug/protein Use

    sheep alpha1 anti trypsin deficiency leads to emphysema

    sheep CFTR treatment of cystic fibrosis

    sheep tissue plasminogen activator treatment of thrombosis

    sheep factor VIII, IX treatment of hemophilia

    sheep fibrinogen treatment of wound healing

    pig, tissue plasminogen activator treatment of thrombosis

    pig factor VIII, IX treatment of hemophilia

    goat human protein C treatment of thrombosis

    goat antithrombin 3 treatment of thrombosis

    goat glutamic acid decarboxylase treatment of type 1 diabetes

    goat Pro542 treatment of HIV

    cow alpha-lactalbumin anti-infection

    cow factor VIII treatment of hemophilia

    cow fibrinogen wound healing

    cow collagen I, collagen II tissue repair, treatment of rheumatoid arthritis

    cow lactoferrin treatment of GI tract infection, treatment of infectious arthritis

    cow human serum albumin maintains blood volume

    chicken, cow, goat monoclonal antibodies other vaccine production

    AplicacionesProduccin de protenas recombinantes.

    Uruguay Dic-2014 27

    Transgnesis en Plantas

  • 18/12/2014

    6

    EJEMPLOS DE MTODOS DE OBTENCIN DE PLANTAS TRANSGNICAS

    Biolgicos: Agrobacteriumtumefaciem o A. rhizogenes

    Fsicos: Lanza genes o Biolstica

    Uruguay Dic-2014 31

    ESQUEMA COMPARATIVO DE OBTENCIN DE PLANTAS TRANSGNICAS

    Uruguay Dic-2014 32

    Uruguay Dic-2014 33

  • 18/12/2014

    7

    Uruguay Dic-2014 39

    Nuevas Tecnologas de Obtencin de OGM

  • 18/12/2014

    8

    CARACTERIZACIN MOLECULAR DE UN OGM

    CARACTERIZACIN MOLECULAR DE UN OVGM

    Proceso que integra el trabajo de diferentes especialistas:

    Presentacin del expediente (Registro del producto)

    Anlisis de laboratorio (Identificacin del OVGM)

    Caracterizacin qumica estructural (aa, peso molecular, glicosilacin, estructura, 3D)

    Caracterizacin funcional.

    Digestibilidad/estabilidad.

    Ensayos fisiolgicos y toxicolgicos (animales, agudos, subcrnicos, mutagenicidad, otros)

    Alergenicidad e historial de uso.

    Uruguay Dic-2014 48

  • 18/12/2014

    9

    Uruguay 2014 49 Uruguay 2014 50

    ANLISIS OVGM: CONCEPTOS

    Caracterizacin: elucidar la estructura molecular del eventotransgnico en el sitio de insercin.

    Deteccin: confirmar la presencia de los elementos genticosde un OGM respecto al T-ADN insertado. (promotor,

    terminador).

    Identificacin: confirmar la presencia de los elementosgenticos que son caractersticos de un evento transgnico

    especifico y que permite determinar su presencia o no.

    Cuantificacin : estimar el contenido del OGM.

    Uruguay Dic-2014 51

    CMO IDENTIFICAR UN OVGM?

    Uruguay Dic-2014 52

    IDENTIFICACIN

    FENOTIPO

    MTODOS BASADOS

    ADN

    MODIFICADO

    MTODOS BASADOS

    EN LA PROTEINA

    EXPRESADA

    La mayora de los OVGM

    comercializados, presentan

    idntica apariencia a su contraparte tradicional

    Las diferencias genticas pueden

    ser determinadas con el anlisis de

    las secuencias del ADN (si es conocida)

    La nueva protena expresada

    puede ser detectada por mtodos

    inmuno enzimticos

    ESTRATEGIA DE DETECCIN DE UN OVGM

    Uruguay Dic-2014 53

    Mtodos de anlisis

    Bio analticosQumicos

    (cidos Grasos)

    (Estructura de la fibra)

    (HPLC/GC)

    Biolgicos

    (Toda la Planta) (Ensayos inmunolgicos)

    Protenas(Ensayos inmunolgicos)

    ADN

    (PCR)

    FenotipoGenotipo

    Uruguay Dic-201454

    Material crudo IngredienteProducto final

    Procesamiento Procesamiento

    Muestra laboratorio

    Muestra anlisis/

    muestra analtica

    ADN

    Protena

    extraccin

    extraccin

    Preparacin muestra

    /homogenizacin

    Identificacin y

    semicuantificacin

    OGM

    ELISA/STRIP

    a) Deteccin OGM

    b) Identificacin OGM

    c) Cuantificacin OGM

    PCR cualitativo

    PCR cuantitativo

    Procedimientos para la deteccin de un OVGM

  • 18/12/2014

    10

    ANLISIS DE OVGM BASADO EN ENSAYOS INMUNO ENZIMTICOS

    Uruguay Dic-2014 55

    ANLISIS DE OGM BASADO EN PCR

    Uruguay Dic-2014 56

    VENTAJAS Y DESVENTAJAS DE LOS MTODOS ADN& PROTENAS

    Uruguay Dic-2014 57 Uruguay Dic-2014 58

    OTRAS VAS DE CARACTERIZACIN DE UN OGM

    ANLISIS DE RIESGO=EVALUACIN INOCUIDAD

    1. Efecto pleiotrpicos. 2. Metablicos.

    3. Mutacionales.4. Efectos y propiedades nueva(s) protena(s)

    expresadas.5. Composicin, valor nutricional.

    6. Toxinas y anti-nutrientes naturales del alimento.

    Equivalencia Sustancial!

    OECD (Organizacin para cooperacin econmica y el desarrollo 1993)

    Uruguay Dic-2014

    59

    MARCO DE LA EVALUACIN DE LA INOCUIDAD DE LOS ALIMENTOS

    (045 DIRECTRICES CODEX ALIMENTARIUS)

    A) Descripcin de la planta de ADN recombinante;B) Descripcin de la planta base y de su utilizacin como

    alimento;C) Descripcin del organismo u organismos donantes;D) Descripcin de la modificacin o modificaciones genticas;E) Caracterizacin de la modificacin o modificaciones

    genticas;

    F) Evaluacin de la inocuidad:a) sustancias expresadas (sustancias distintas de cidos nucleicos);b) anlisis de los componentes esenciales;

    c) evaluacin de los metabolitos;

    d) elaboracin del alimento;e) modificacin nutricional; y

    G) Otras consideraciones.

    60Uruguay Dic-2014

  • 18/12/2014

    11

    ES(1993-2002-2013)

    1. IDENTIDAD.

    2. LA FUENTE DE ORIGEN Y LA COMPOSICION DEL OGM.

    3. PROCESO DE TRANSFORMACIN.

    4. EL PRODUCTO DE LA EXPRESIN DEL NUEVO ADN.(alergenicidad y toxicidad)

    5. POSIBLES EFECTOS SECUNDARIOS EXPRESIN GEN.(micro-nutrientes crticos anti-nutrientes, factores txicos endgenos, alrgenos, etc.)

    OECD/FAO/WHO, 2000,2002 OEM, EFSA 2012

    Uruguay Dic-2014

    61

    APLICACIONES DE LA ES.

    1. El alimento o ingrediente AGM es sustancialmenteequivalente al anlogo convencional, en cuanto a su

    composicin qumica, aspectos agronmicos ytoxicolgicos.

    2. El alimento o ingrediente AGM es sustancialmente

    equivalente al anlogo convencional, excepto poralgunas pocas diferencias definidas con claridad.

    3. El alimento o ingrediente AGM NO es sustancialmente

    equivalente al anlogo convencional.

    DONALDSON, MAY, 1999.

    Uruguay Dic-2014

    62

    Uruguay Dic-2014

    63

    EVALUACIN DE LA ES DE AGM

    Uruguay Dic-2014

    64

    ANLISIS ES RESPECTO A EFECTOS DEL PROCESAMIENTO

    ANLISIS DEL ADN INSERTADO

    Gen de seleccin (0,1-1 g ADN/da vs 0,000001 g ADNr).(JONAS ET AL 2001; EFSA 2004)

    1. Genes de resistencia Kanamicina e Higromicina

    2. Genes de resistencia a la Ampicilina (uso restringido a estudio de campo experimentales y no plantas comercializadas).

    3. No pueden estar presente en ninguna especie vegetal GM.

    Procesamiento del ADN.(BETZ,FUCHS, 2000)

    Transferencia de genes desde el alimento modificado hacia las bacterias intestinales.(KUPFER ET AL, 1999)

    Uruguay Dic-2014

    65

    Ensayos de toxicologa aguda en animales, de las nuevas protenas sin historia alimentaria.(Si procede)

    Ensayos toxicologa subcrnica o crnica de las nuevas protenas o del alimento completo.(Si Procede)

    Estos estudios deben considerar:

    - limitacin calrica del animal

    - las consecuencias negativas de uso nico de un producto/alimento (desequilibrios nutricionales y efectos txicos por ingestin excesiva de un componente)

    Uruguay Dic-2014

    66

    ANLISIS TOXICOLGICO EN ANIMALES

  • 18/12/2014

    12

    ESTUDIOS DE TOXICIDAD REALIZADOS A PROTENAS EXPRESADAS EN AGM COMERCIALIZADOS

    Uruguay Dic-2014

    67

    ESTUDIOS TOXICOLGICOS REALIZADOS A OGM.ENSAYOS CON ANIMALES

    Uruguay Dic-201468

    EQUIVALENCIA NUTRICIONAL

    Exmenes para la deteccin del gen insertado o la protena expresada por este gen. (leche, carne, huevos)

    OGM 3ra generacin se debe considerar la diferencia de la composicin ( carotenoides, Vitaminas, cidos grasos, etc) y su efecto en el procesamiento sobre el

    tenor de nutrientes o biodisponibilidad.

    (EINSPAINER et al., 2001).

    Uruguay Dic-2014

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    EQUIVALENCIA NUTRICIONALPermite determinar la ocurrencia de problemas nutricionales cuando

    el OGM es fuente crtica de nutrientes.

    Est diseada a la demostracin de su equivalencia en Zootecnia.

    Equivalencia al linaje parenteral.( Inocuidad)

    Uruguay Dic-2014

    70

    DESEMPEO DE ANIMALES ALIMENTADOS CON

    CULTIVARES GM

    Uruguay Dic-2014

    71

    ANLISIS TOXICOLGICO (ALERGENICICAD Y TOXICIDAD)

    el 90 % alergias alimentarias: man, soya, leche, huevo, pescado,crustceos, trigo, nueces (METCALFE et al.,1996).

    Resistencia a la digestin, alta estabilidad trmica, homologa aaantignicos, resistencia a la glicosilacin

    Identificacin de alrgenos y toxinas conocidas en las especiesdonantes y receptoras a travs de la homologa de secuenciasmediante el uso de bases de datos pblicas. Estudios bioinformtica6-8 aa, homologa protenas alergnicas)

    Similitud de los nuevos productos expresados con alrgenosconocidos.

    Ensayos inmunolgicos.

    Uruguay Dic-2014

    72

  • 18/12/2014

    13

    ALERGENICIDAD.(RBOL DE DECISIONES)

    Uruguay Dic-2014

    73

    BSQUEDA DE INFORMACIN EN BASES DE DATOS

    BLAST (Basic Local Alignment Search Tool/Programainformtico de alineamiento de secuencias de tipolocal)

    Creado por los institutos nacionales de salud de EE.UU.

    Puede usarse desde el servidor del Centro Nacional para la Informacin Biotecnolgica (NCBI)

    Utiliza un algoritmo heurstico.

    Blastn, Blastp, PDB, PFAM, UniProt data, InterPro, Allergenic Database, Allergen Database for Food Safety, ect.

    Uruguay Dic-2014

    74

    BLAST (Programa informtico de alineamiento de secuencias de tipo local)

    No garantiza que las secuencia que alinea

    sean homlogas o que tengan la misma

    funcin.

    Su puntuacin depende del largo de la secuencia.

    El eValor depende del tamao de la base de datos

    Uruguay Dic-2014

    75

    EFECTOS INTENCIONALES Y NO INTENCIONALES.

    Alteraciones que puedan aparecer en varios niveles:

    - morfologa de la planta y/o tejido.

    - metabolismo, composicin qumica.

    - influencia del medio ambiente sobre la expresin

    gnica.

    Uruguay Dic-2014 76

    EFECTOS NO INTENCIONALES DETECTADOS EN PRODUCTOS GM.

    Uruguay Dic-2014

    77

    PAISES Y MEGAPAISES PRODUCTORES CULTIVOS BIOTECNOLGICOS 2013FUENTE: CLIVE JAMES, 2013.

    Uruguay Dic-2014

    78

  • 18/12/2014

    14

    SITUACIN MUNDIAL DE LOS CULTIVOS BIOTECNOLGICOS GM/2013

    Uruguay Dic-2014

    79 Uruguay Dic-2014 80

    MUCHAS GRACIAS POR SU ATENCIN