biosintesis protein
DESCRIPTION
Materi kuliah Biokimia dengan judul Biosintesis ProteinTRANSCRIPT
FAKULTAS PERTANIAN UNIVERSITAS RIAU2010
BIOSINTESIS PROTEIN
Ir. EVY ROSSI, MSC
• Terjadi di permukaan Ribosom• Arah perpanjangan polipeptida dimulai dari
terminal N• Ratusan macam protein dapat disintesis sesuai blue
print rancangannya• Blue printnya adalah segmen nukleotida dalam
DNA• Gen (segmen nukleotida) harus terlebih dahulu
disalin menjadi RNA
TAHAPAN BIOSINTESIS PROTEIN
1. Aktifasi2. Inisiasi3. Elongasi4. terminasi
KOMPONEN-KOMPONEN YANG DIBUTUKAN:
1. TAHAP AKTIFASI
a. Asam amino b. tRNA c. aminoasil-tRNA sinthetase d. ATP e. Mg
…….KOMPONEN-KOMPONEN YANG DIBUTUKAN:
2. TAHAP INISIASIa. Sub Unit Ribosom 30Sb. mRNA pembawa kodon untuk sintesis
polipeptidac. Initiasi asam amino yang terikat pada
tRNA/d. Inisiasi faktor (IF-1, IF-2 dan IF-3)e. GTPf. Sub Unit Ribosom 50Sg. Mg.
…….KOMPONEN-KOMPONEN YANG DIBUTUKAN:
3. TAHAP ELONGASI a. Fungsional Ribosom 70S b. Aminoasil-tRNA (dispesifikasikan oleh Kodon) c. Faktor Elongasi (IF-Tu, EF-Ts dan EF-G) d. GTP
…….KOMPONEN-KOMPONEN YANG DIBUTUKAN:
4. TAHAP TERMINASI a. Ribosom 70S b. Kodon terminal di mRNA c. Faaktor untuk melepaskan polipeptida (R1, R2 dan R3)
1. Tahap Aktivasi
• Ke 20 asam amino penyusun protein berikatan secara kovalen dengan tRNA, dan membutuhkan energi (ATP).
• Enzim amino asil-t-RNA sinthetase mengkatalis reaksi ini dengan bantuan Mg.
Struktur t-RNA
2. Tahap Inisiasiasi
• Dibutuhkan initiasi Kodon AUG• Dimulai dengan melekatnya Metionin bebas
ke ujung tRNA dgn bantuan enzim metionil t-RNA sinthetase
• Terdapat 2 macam tRNA yaitu: • Pada bakteri diperlukan kedua tRNA tsb
untuk response kodon AUG (mrtionin) --- response metionin pd internal polipeptida
adalah
………2. Inisiasi
• Pada sel prokariot metionin untuk inisiasi atau pun untuk internal polipeptida dibawa melalui
Tiga langkah pada Tahapan Inisiasi
1. Ribosom sub unit 30S beikatan dengan IF-1 dan IF-3, dimana IF-3 melindungi agar tidak cepat bersatunya Ribosom 30 S dengan 50 S
Kemudian mRNA berikatan dengan ribosom 30S
2. Kompleks 30S Ribosom sub unit, IF3 dan mRNA bergabung dengan GTP yang diikat oleh IF-2 dan
3. Kompleks yang terbentuk oada langkah 2, bersatu dengan Ribosom 50S, ikatan GTP dg IF-2 dihidrolisis menghasilkan GDP dan Pi, sehingga keluar dari kompleks, begitu juga dgn IF-1 dan IF-3
Gambar: Langah2 tahapan
Inisiasi
3. Tahap Elongasi
•Berikatan aminoasil-tRNA dengan GTP yang telah berikatan dengan EF-Tu.•Kompleks aminoasil-tRNA-GTP-EF-Tu terikat
pada celah (P) pada ribosom.•GTP akan mengalami hidrolisis sehingga
terbentuk EF-Tu-GDP dan kemudian dilepaskan dari Ribosom 70 S• EF-Tu-GDP akan beregenerasi untuk
menghasilkan GTP dengan bantuan EF-Ts
Tahap 1.Elongasi
• Ikatan peptida pertama terbentuk antara asam amino pada celah asil (P) dengan asam amino pada celah Peptidil (A)
• Enzim yang mengkatalis pembentukan ikatan peptida adalah peptidil transferase
Elongasi Tahap 2: Elongasi Tahap 2: Pembentukan ikatan peptidaPembentukan ikatan peptida
Tahap 2.Elongasi
• Ribosom memindahkan satu kodon, perpindahan ini menyebabkan bergesernya antikodon pada peptidil t-RNA yang masih berikatan pada kodon kedua pada mRNA• pergeseran ini memerlukan EF-G (translocase)• Energi disediakan dari • hidrolisis GTP
4. Tahap Terminasi
• Ditandai adanya salah satu kodon UAA, UAG dan UGA pada mRNA
• Diperlikan 3 termination Faktor (Release Factors) yaitu protein RF-1, RF-2, dan RF-3 yang berperan dalam:
1. Hydrolisis ikatan terminal peptidil-tRNA 2. Melepaskan polipeptida dari tRNA yang
terakhir 3. Memisahkan ribosom 70S menjadi 50S dan 30S untuk siklus biosintensis polipeptida berikutnya
Tahap Terminasi
KODE GENETIKKODE GENETIK