6 parámetros genéticos

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Genética de Poblaciones Cátedra de Genética y Mejoramiento Animal Parámetros Poblacionales para Caracteres Cuantitativos 1.- Media de la población 2.- Varianza fenotípica. Varianza genotípica. Varianza ambiental. Relación entre variabilidad y frecuencias génicas. Otros Efectos 3.- Heredabilidad. Concepto. Estimación. Importancia de la heredabilidad 4.- Caracteres repetibles. Repetibilidad. Estimación 5.- Correlaciones entre caracteres: Correlación fenotípica. Correlación ambiental. Correlación genética.

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Page 1: 6 Parámetros Genéticos

Genética de Poblaciones Cátedra de Genética y Mejoramiento Animal

Parámetros Poblacionales para Caracteres Cuantitativos

1.- Media de la población

2.- Varianza fenotípica. Varianza genotípica. Varianza ambiental. Relación entre variabilidad y frecuencias génicas. Otros Efectos

3.- Heredabilidad. Concepto. Estimación. Importancia de la heredabilidad

4.- Caracteres repetibles. Repetibilidad. Estimación

5.- Correlaciones entre caracteres: Correlación fenotípica. Correlación ambiental. Correlación genética.

Page 2: 6 Parámetros Genéticos

Modelo GenéticoPi = Gi + Ei

Pi = Gai + Gdi + Gii + Epi + Eti

Pi : fenotipo o valor fenotípico del individuo i

Gi : genotipo o valor genético del individuo i

Gai : valor genético aditivo (genotipo aditivo) del individuo i;

Gdi : valor genético por dominancia (genotipo por dominancia) del

individuo i;

Gii : valor genético por interacciones (genotipo por interacciones) del

individuo i

Ei : ambiente o desviación ambiental que afecta al individuo i

Epi: efecto ambiental permanente que afecta al individuo i

Eti: efecto ambiental temporario que afecta al individuo iConsiderando todos los elementos que componen el valor fenotípico de un individuo, sólo el valor genético aditivo es heredable.

Page 3: 6 Parámetros Genéticos

Repaso Covarianza

( )( ) ( )

N

YXYXCov

N

iYiXi∑

=

−−= 1

.,

µµ( )

( ) ( )

1

.,ˆ 1

−−=

∑=

n

YYXXYXvoC

n

iii

Page 4: 6 Parámetros Genéticos

COVARIANZA ENTRE PARIENTES

Supuestos a considerar:

1-la población está en equilibrio, bajo apareamiento aleatorio y que la selección, mutación, etc., están ausentes.

2-ausencia de Ligamiento

Page 5: 6 Parámetros Genéticos

Padre X: Px = GX + EX Hijo Y: PY = GY +

EY

Cov (Padre, Hijo ) = Cov (PX, PY)

Cov (Padre, Hijo) = Cov ((GX + EX) , (GY +

EY))

Cov(Padre, Hijo) = Cov (GX,

GY)

Genotipo (Padre)= GX = AX + DX + IX

Genotipo (Hijo) = GY = AY + DY + IY

1-Covarianza Genética

Covarianza PADRE –HIJO (COVPH).

Page 6: 6 Parámetros Genéticos

Cov (Padre, Hijo) = Cov (Gx, ½ GY) = Cov ((Ax+DX), ½ (AY+DY))

Cov (Padre, Hijo) = Cov (AX, ½AY)

Sacando la constante ½ fuera del paréntesis:

Cov (Padre, Hijo)= 1/2 Cov (AX,AY)

Cov (Padre, Hijo) = ½ σ2

A

Cov (X,Y) = axy σ2

A

En General

Page 7: 6 Parámetros Genéticos

Tipos de parientes

Cov σ2A σ2

D

progenie - 1 padre PP 0.50 0

hermanos enteros HE 0.50 0.25

medio hermanos MH 0.25 0

COMPONENTES GENOTÍPICOS DE VARIANCIA

Page 8: 6 Parámetros Genéticos

2-Covarianza Ambiental

Page 9: 6 Parámetros Genéticos

Caracteres Cuantitativos

• Media Fenotípica

• Varianza Fenotípica y sus componentes

• Repetibilidad (r)

• Heredabilidad en sentido Amplio ( H2 )

• Heredabilidad en sentido Estricto ( h2 )

• Correlaciones entre caracteres

Page 10: 6 Parámetros Genéticos

Media de la Población (μ)

p = 0.70 q = 0.30

GenotipoFrecuencia

Genotípica (EHW)Valor

GenéticoFrecuencia x

Valor

A1A1 P = p2 = 0.49 10 (0.49).(10)

A1A2 H = 2pq = 0.42 10 (0.42).(10)

A2A2 Q = q2 = 0.09 2 (0.09).(2)

μ = ∑ [ (Frecuencia Genotípica ). (Valor Genético) ]

VALIDO PARA CADA PAR GENICO

n

Pn

ii∑

== 1µEn la práctica:

Page 11: 6 Parámetros Genéticos

Causas de la Variación Continua

segregación simultánea de muchos genes (carácter poligénico)

acción de muchos factores no genéticos (ambientales)

Page 12: 6 Parámetros Genéticos

Distribución Normal

valor

frec

uen

cia

media

variabilidad

Page 13: 6 Parámetros Genéticos

Caracteres Cuantitativos

valor fenotípico

frec

uen

cia

valor fenotípico medio

variabilidad

00P µ=

σσσ2

E

2

G

2

P±=

Page 14: 6 Parámetros Genéticos

Varianza Fenotípica

grado en que los individuos difieren en sus valores fenotípicos

σσσ2

E

2

G

2

P±=

Varianza Fenotípica = Varianza Genética + Varianza Ambiental

Page 15: 6 Parámetros Genéticos

1-Varianza Genotípica

σσσσ2

Gi

2

Gd

2

Ga

2

G++=

Varianza Genética = Varianza G. Aditiva + Varianza G. Dominancia + Varianza G. Interacciones

Page 16: 6 Parámetros Genéticos

La magnitud de la media fenotípica y de la varianza fenotípica dependen de

los valores de frecuencias génicas

Relación σ2 G y las Frecuencias Génicas

σ2G

= σ2A

Page 17: 6 Parámetros Genéticos

σσσ2

Et

2

Ep

2

E+=

2-Varianza Ambiental

Page 18: 6 Parámetros Genéticos

Ejemplo: producción de leche (kg.)

μ = 7500 kg

22

Pkg 1.000.000σ =

22

Gkg 350.000σ = 22

Gakg 250.000σ = 22

Gdkg 80.000σ = 22

Gikg 20.000σ =

22

Ekg 650.000σ = 22

Epkg 150.000σ = 22

Etkg 500.000σ =

Page 19: 6 Parámetros Genéticos

3-Correlación G-E

Los valores genotípicos y las desviaciones ambientales NO SON independientes entre sí.

Page 20: 6 Parámetros Genéticos

4-Interacción G-E

Comportamiento relativo diferencial que exhiben los genotipos cuando se los somete a diferentes ambientes

Page 21: 6 Parámetros Genéticos

σ 2

GE

2

E

2

G

2

P 2Cov(GE) σσσ +++=

Correlación GE

Interacción GE

VARIACION FENOTIPICA TOTAL

Page 22: 6 Parámetros Genéticos

Se pueden estimar otros parámetros, que son proporciones de los distintos componentes de la Varianza Fenotípica

• Repetibilidad

• Heredabilidad en Sentido Amplio

• Heredabilidad en Sentido Estricto

Page 23: 6 Parámetros Genéticos

• en sentido amplio

σσ

2

P

2

G2H =

Heredabilidad

Proporción de la variación fenotípica de una característica, en una población que se debe a la variación genética.

0.35kg 1.000.000

kg 350.000H

2

2

2

P

2

G2

σσ ===

Ejemplo: producción de leche (kg.)

Page 24: 6 Parámetros Genéticos

• en sentido estricto

σσ

2

P

2

Ga2h =

Heredabilidad

Proporción de la variación fenotípica de una característica, en una población que se debe a la variación genética aditiva.

σ2

Ga

σ2

Ga

σσ2

Gi

2

Gd+

σσ2

Gi

2

Gd+

σ2

E

σ2

E

h2 alta

h2 baja

Page 25: 6 Parámetros Genéticos

Ejemplo: producción de leche (kg.)

0.25kg 1.000.000

kg 250.000h

2

2

2

P

2

Ga2

σσ ===

El 25 % de la variación fenotípica para la producción de leche en esta población se debe a la variación genética aditiva

Page 26: 6 Parámetros Genéticos

Heredabilidad: Estimación

Covarianza ENTRE PARIENTES (medida de

SEMEJANZA)

PARIENTES (comparten genes)

RegresiónRegresión

PARIENTES PARIENTES DIRECTOSDIRECTOS

( )σ 2

,

X

YX

YXCovb =

Page 27: 6 Parámetros Genéticos

padres

hijos

Heredabilidad: Estimación

covarianza

covarianza regresión

σ2

Ga1/2 σσ

2

P

2

Ga)/(1/2b̂ = XY,

XY

2 b̂a

1h =

Page 28: 6 Parámetros Genéticos

Caracteres Ejemplos Heredabilidad Valores

Reproductivos

Intervalo entre partos

Baja 0.05 a 0.15Duración de la gestación

Tamaño de camada

Producción

Ganancia de peso

Media – Alta 0.20 a 0.40Eficiencia alimentaria

Producción de leche

Producción de lana

AnatómicosDiámetro de tórax

Alta > 0.50Longitud de fémur

Algunos Valores

Page 29: 6 Parámetros Genéticos

CONSIDERACIONES FINALES Heredabilidad

-Está limitada a un carácter y una población,

-Se refiere a la variación genética alrededor de la media dela población en estudio y describe sólo la Varianza Genética dentro de ésta,

-Pertenece solamente a la población donde fue estimada

-Las diferencias de la h2 entre distintas poblaciones para un mismo carácter y especie pueden ser de origenGenético y/o Ambiental, aunque otras causas son inherentes al método de estimación , cantidad y fuente de datos

Page 30: 6 Parámetros Genéticos

Repetibilidad

i

Caracteres Repetibles: aquellos que pueden medirse más de una vez en la vida del individuo

Registro: cada una de las medidas fenotípicas de un individuo para un determinado caracter

= j ésimo registro del individuo iijP

i1P

i2P

= 1er registro del individuo i

= 2do registro del individuo i

Page 31: 6 Parámetros Genéticos

ijiiij EtEpGP ++=

i1iii1 EtEpGP ++=

i2iii2 EtEpGP ++=

Constantes

i

Repetibilidad

Page 32: 6 Parámetros Genéticos

1er Registro 2do registro

PA1 PA2

PB1 PB2

... ...

PZ1 PZ2 σσσ2

P

2

Ep

2

Gr+

=

• Correlación entre las sucesivas mediciones del mismo carácter en el mismo grupo de individuos = repetibilidad

proporción de la varianza fenotípica de un carácter debida a la varianza genética total y a la varianza ambiental permanente

Repetibilidad

Page 33: 6 Parámetros Genéticos

Ejemplo: producción de leche (kg.)

0.50kg 1.000.000

kg 150.000kg 350.000r

2

22

2

P

2

Ep

2

G

σσσ =+=

+=

El 50 % de la variación fenotípica para la producción de leche en esta población se debe a la variación genética y a la ambiental permanente

Page 34: 6 Parámetros Genéticos

Carácter Repetibilidad (r)

Intervalo entre partos 0.02 a 0.20

Peso al destete (como carácter materno) 0.40 a 0.50

Peso de vellón 0.50 a 0.60

Diámetro de fibras 0.50 a 0.60

Número de corderos 0.10 a 0.30

Producción de leche 0.40 a 0.50

Intervalo entre partos (bovinos para leche) 0.10 a 0.30

Número de lechones nacidos 0.10 a 0.25

Peso de huevo 0.80 a 0.90

Repetibilidad

Page 35: 6 Parámetros Genéticos

a.- una manera de estimar registros futuros de los animales

b.- un elemento para decidir si son necesarias más de una medición para retener individuos como productores en una población.

c.- indica básicamente si una medición es buena indicadora de las siguientes o no: Ejemplo: Una alta repetibilidad indica alta correlación entre medidas sucesivas

Importancia de la repetibilidad .

Page 36: 6 Parámetros Genéticos

Correlaciones entre caracteres

Fenotípicas

Genéticas

Ambientales

11111 EGPX +=−= µ

22222 EGPX +=−= µ

Modelo Genético para las dos características:

Page 37: 6 Parámetros Genéticos

21

21

21 EGP σσσ += 2

222

22 EGP σσσ +=

Varianza Fenotípica entre dos caracteres

Correlación Fenotípica

212121 EEGGPP σσσ +=

Covarianza Fenotípica entre dos caracteres

Page 38: 6 Parámetros Genéticos

( )

21

21

2

2

2

1

21

..21 PP

PPCov

PP

PP

PPr σσσσσ ==

Correlación Fenotípica entre dos caracteres

Page 39: 6 Parámetros Genéticos

carácter 1

carácter 2

carácter 1

carácter 2

Pi

Pk

Correlación Genética

se mide un carácter en un pariente y el otro carácter en el otro pariente.

Page 40: 6 Parámetros Genéticos

( )

21

21

2

2

2

1

21

..21 GG

GGCov

GG

GG

GGr

σσσσσ ==

Correlación Genética

Correlación que existe entre los valores genéticos aditivos de dos características

Page 41: 6 Parámetros Genéticos

( )

21

21

2

2

2

1

21

..21 EE

EECov

EE

EEEE

rσσσσ

σ ==

Correlación Ambiental

la correlación entre los desvíos ambientalesque tienen influencia sobre los dos caracteres

Page 42: 6 Parámetros Genéticos

Al igual que la heredabilidad debe ser estimada a partir de la información de parientes, con la diferencia que ahora se mide un carácter en un pariente y otro en el otro pariente.

Regresión Progenie Progenitor Medio Hermanos Hermanos enteros.

Al igual que la heredabilidad es un parámetro poblacionalNo es constante ya que dependen de p y q así como del ambienteEs menos confiable ya que depende del ligamiento que tiende adesaparecer

Métodos de Estimación

Page 43: 6 Parámetros Genéticos

(σX,Y) = ∑(X-μx)(Y-μy)

n – 1

rrXY XY = =

Correlación: mide el grado de asociación entre dos caracteres.

r x,y= (σX,Y)/ σX σy

Correlaciones entre caracteres

Page 44: 6 Parámetros Genéticos

Carácter PN PD AM GDP PF

PN 0.30 0.40 -0.12 0.46 0.48

PD 0.25 -0.20 0.15 0.70

AM 0.14 - -0.07

GDP 0.28 0.98

PF 0.30

Heredabilidades y correlaciones genéticas de características de crecimiento en bovinos

REFERENCIAS: PN = peso al nacer; PD = peso al destete; AM = aptitud materna; GDP = ganancia diaria de peso; PF = peso final

La diagonal representa la heredabilidad. Por encima las correlaciones genéticas

FUENTE: Assotiation for the Advancement of Animal Breeding and Genetics (AAABG) – Australia

Page 45: 6 Parámetros Genéticos

rG rP

Vacuno de leche

Producción de leche: producción de grasa + 0,80 + 0,90

Producción de leche: producción de proteína + 0,90 + 0,95

Producción de leche: porcentaje de grasa - 0,30 - 0,20

Producción de grasa: producción de proteína + 0,90 + 0,95

Cerdo

Tasa de crecimiento: índice de conversión - 0,80 - 0,75

Tasa de crecimiento: ingestión de alimento + 0,40 + 0,45

Tasa de crecimiento: espesor grasa dorsal - 0,25 - 0,10

Índice de conversión: espesor grasa dorsal + 0,30 + 0,20

Ovino

Peso vellón limpio: rendimiento + 0,50 + 0,40

Peso vellón limpio: longitud fibra + 0,40 + 0,30

Peso vellón limpio: peso vellón graso + 0,60 + 0.80

Peso vellón limpio: rizos por pulgada - 0,35 - 0,30

Correlaciones Genéticas y Fenotípicas en especies productivas.

Page 46: 6 Parámetros Genéticos

Parámetros Genéticos: Resumen

0

100

200

300

400

500

600

1 2 1

frec

.

Caracteres Cualitativos

Caracteres Cuantitativos

• Frecuencias Génicas (p q)

• Frecuencias Genotípicas (P H Q)

• Media Fenotípica

• Varianza Fenotípica y sus componentes

• Repetibilidad (r)

• Heredabilidad en sentido Amplio ( H2 )

• Heredabilidad en sentido Estricto ( h2 )

• Correlaciones entre caracteres

La magnitud de los parámetros es propia de cada población y no son extrapolables a otras. Son una propiedad de la población evaluada y del ambiente en la cual se desarrolla.

La magnitud de los parámetros es propia de cada población y no son extrapolables a otras. Son una propiedad de la población evaluada y del ambiente en la cual se desarrolla.

Page 47: 6 Parámetros Genéticos

BibliografíaCardellino, R. y J. Rovira. 1987. Mejoramiento Genético Animal. Ed. Hemisferio Sur.Falconer, D. S. 1984. Introducción a la Genética Cuantitativa. CECSA, México.Nicholas, F. W. 1987. Genética Veterinaria. Ed. Acribia.Warwick, E. J. y J. E. Legates. 1980. Cría y Mejora del Ganado. Mc. Graw Hill.